Hola Lorena
Eso lo puedes hacer desde el módulo de cheques, hay un registro llamado "Depósitos"
Selecciona y entra a ese registro y te aparecerá otra pantalla donde puedes crear un nuevo depósito.
Dale clic en "Crear" y te aparecerá otra pantalla donde puedes llenar los datos del nuevo depósito a crear.

Nro: Número correlativo que lo genera automáticamente el hansa
Comentario: Cualquier referencia que quieras darle al depósito
Fecha: En la que se está haciendo el depósito
Destino: Presiona Ctrl + Enter y elige la forma de pago donde depositará el efectivo y cheques
Contado: Ingresa la cantidad que se depositará
Tipo contado: Presiona Ctrl + Enter y elige la forma de pago de donde saldrá el efectivo
Total: Es el total que se está depositando, Cheques más efectivo. En este campo puedes presionar ctrl + Enter para seleccionar los cheques que se depositarán. Aparecerá una pantalla de donde puedes elegir los cheques que se depositarán.

Tilda la opción ok y guarda una vez que hayas llenado todos los datos.
Espero esto te sirva
Saludos