De ser así debes validar el error que esta devolviendo AFIP.
Para ello puedes ir a:
Módulo>> Ventas>> Registros>> Ubicar la factura que deseas enviar.
Al abrir el registro, en el panel superior derecho, click en el ícono en forma de X.
Alli se encuentra adjuntado el error que esta generando la factura. El mismo debe contener una descripción como la siguiente: Estado Archivos Electrónicos: xxx Estado Reg. Elec. xxx. Al abrirlo visualiza el campo Comentario.
Saludos,
HansaWorld